氨基酸的转运方式是通过转运蛋白进行的。这些转运蛋白可以高度亲水性，以达到转运氨基酸的效率，这些转运蛋白分子的内部可以认定氨基酸的底物性质，并有助于矫正分子应对外部环境的特征，从而有利于氨基酸进入细胞。
尽管转运蛋白有效地帮助氨基酸进入细胞，但研究表明，离子通道也可以以独特的两个步骤，影响氨基酸转运。其中，第一步叫做“缓冲”，它有助于将游离质子和正荧光离子安全地从胞外排入胞腔，从而形成一个对氨基酸转运更为友好的环境；第二步叫做“专注”，离子通道分子的半通透性和脉冲结构，可以促进空间低溫学和调节精确的氨基酸转运。
因此，转运蛋白和离子通道可以共同作用，形成一个全面有效的氨基酸转运系统，并帮助氨基酸运动通过细胞膜，进入一般细胞。
